来自德国的一个研究组织对多个和玉米黑穗病有关的重要基因进行了研究，对玉米丝黑穗病和玉米普通黑穗病致病真菌的基因组进行了分析比对。研究结果发现，这两种真菌分别入侵作物的差异组织，普通黑穗病仅熏染作物的叶，穗和雄花，而丝黑穗致病菌可以熏染植物的所有组织，却只会在作物的花上泛起症状。

　　研究人员发现，这两种真菌熏染的宿主细胞的效应器卵白中90%的基因编码是相同的，仅在编码序列上有区别而已。研究人员已经确定了这两个基因组中43个序列差异的区域，发现这43个区域中包罗所有普通黑穗病致病真菌的基因簇，此外，科学家还任意选择了6个“差异区”，发现：其中4个和普通黑穗病致病菌的毒性有关，其中一个和卵白质排泄无关。

　　这些真菌的基因差异造成了它们通过差异的方式熏染宿主，种间基因的差异也造成了它们差异的“生活方式”，这些差异也是由于宿主对这两种真菌的“进攻基因” 进化出了差异的防御方式，研究人员也指出，这些差异，也是这两种真菌和宿主之间“军备竞赛”的产物，三者之间的一个泛起任何的变化，都市使得另外两方“进行还击”之后再相互适应。